A partir de Noviembre de 2000 se adoptó una nueva regulación (Rto. CE nº 2698/2000) por la que se establecieron las bases del programa MEDA II para el período 2000 - 2006.

Los objetivos principales de la cooperación son el fortalecimiento de la estabilidad política y de la democracia, la creación de una zona de libre comercio euromediterránea y desarrollo de la cooperación económica; y la consideración de la dimensión cultural y humana.

Los Países Terceros Mediterráneos (PTM) beneficiarios de este programa son: Marruecos, Argelia, Túnez, Egipto, Jordania, Siria, Líbano, Territorios Ocupados de Cisjordania y Gaza, Israel, Turquía, Chipre y Malta.

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